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lncRNA
當前位置:首頁 > 科研全覆蓋檢測 > 分子生物學檢測 > IncRNA > lncRNA

 

 

IncRNA PCR

長鏈非編碼RNA (long non-coding RNA,IncRNA) 是一類長度在200nt以上,不編碼蛋白的RNA分子。研究發(fā)現(xiàn),lncRNA具有保守的二級結(jié)構(gòu),可以與蛋白、DNA 和RNA相互作用,參與了X染色體沉默、基因組印跡、染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活或抑制、轉(zhuǎn)錄干擾、核內(nèi)運輸?shù)榷喾N生物學過程的調(diào)控,與各種疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),成為近年來非編碼RNA和表觀遺傳研究的熱點和重點。

附錄.如何開展lnc RNA研究?

01 差異lnc RNA篩選
去核糖體RNA法富集lncRNA進行鏈特異建庫測序
基因編輯:
CRISPR-Cas9 crRNA
文庫
02 生物信息分析
Inc RNA表達差異分析
新IncRNA預測
IncRNA-mRNA 共表達分析
IncRNA功能預測
03 體外實驗功能驗證
功能獲得性研究:過表達載體
功能缺失性研究:siRNA,Smart Silencer,ASO
IncRNA檢測:qPCR,FISH
IncRNA功能驗證RNA pull-down,CLIP-seq,ChIRP-seq,RIP-seq等
基因編輯:
CRISPR-Cas9系列及配套產(chǎn)品
04 體內(nèi)實驗功能驗證
構(gòu)建動物模型
導入過表達載體、siRNA或ASO
檢測動物表型變化,生化指標和相關(guān)基因表達

可檢測樣本類型

里來結(jié)合在lncRNA研究領(lǐng)域多年的經(jīng)驗,根據(jù)提取方式、建庫難度和類型不同,可提供多種lncRNA測序服務:
組織、細胞lncRNA測序
外泌體(Exosomes)lncRNA測序

常規(guī)檢測流程

qRT-PCR技術(shù)以其高靈敏度及高準確性,已成為RNA表達豐度檢測的一個重要標準,二代測序及芯片數(shù)據(jù)往往都需要qRT-PCR檢測進行驗證,常規(guī)實驗中的相對定量檢測或絕對定量檢測,qRT-PCR也是最合適的方法。
目前數(shù)據(jù)庫對lncRNA序列的收錄及注釋都不完備,大部分lncRNA的表達豐度也比較低,對lncRNA引物設(shè)計策略及qRT-PCR檢測提出了一定的挑戰(zhàn)。
lnkRNA需使用專用引物與專用試劑盒,詳情請咨詢。
引物設(shè)計
RNA提取和逆錄轉(zhuǎn)
Real-time RCP
數(shù)據(jù)分析
完成
檢測平臺
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lncRNA

 

 

IncRNA PCR

長鏈非編碼RNA (long non-coding RNA,IncRNA) 是一類長度在200nt以上,不編碼蛋白的RNA分子。研究發(fā)現(xiàn),lncRNA具有保守的二級結(jié)構(gòu),可以與蛋白、DNA 和RNA相互作用,參與了X染色體沉默、基因組印跡、染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄激活或抑制、轉(zhuǎn)錄干擾、核內(nèi)運輸?shù)榷喾N生物學過程的調(diào)控,與各種疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),成為近年來非編碼RNA和表觀遺傳研究的熱點和重點。

附錄.如何開展lnc RNA研究?

01 差異lnc RNA篩選
去核糖體RNA法富集lncRNA進行鏈特異建庫測序
基因編輯:
CRISPR-Cas9 crRNA
文庫
02 生物信息分析
Inc RNA表達差異分析
新IncRNA預測
IncRNA-mRNA 共表達分析
IncRNA功能預測
03 體外實驗功能驗證
功能獲得性研究:過表達載體
功能缺失性研究:siRNA,Smart Silencer,ASO
IncRNA檢測:qPCR,FISH
IncRNA功能驗證RNA pull-down,CLIP-seq,ChIRP-seq,RIP-seq等
基因編輯:
CRISPR-Cas9系列及配套產(chǎn)品
04 體內(nèi)實驗功能驗證
構(gòu)建動物模型
導入過表達載體、siRNA或ASO
檢測動物表型變化,生化指標和相關(guān)基因表達

可檢測樣本類型

里來結(jié)合在lncRNA研究領(lǐng)域多年的經(jīng)驗,根據(jù)提取方式、建庫難度和類型不同,可提供多種lncRNA測序服務:
組織、細胞lncRNA測序
外泌體(Exosomes)lncRNA測序

常規(guī)檢測流程

qRT-PCR技術(shù)以其高靈敏度及高準確性,已成為RNA表達豐度檢測的一個重要標準,二代測序及芯片數(shù)據(jù)往往都需要qRT-PCR檢測進行驗證,常規(guī)實驗中的相對定量檢測或絕對定量檢測,qRT-PCR也是最合適的方法。
目前數(shù)據(jù)庫對lncRNA序列的收錄及注釋都不完備,大部分lncRNA的表達豐度也比較低,對lncRNA引物設(shè)計策略及qRT-PCR檢測提出了一定的挑戰(zhàn)。
lnkRNA需使用專用引物與專用試劑盒,詳情請咨詢。
引物設(shè)計
RNA提取和逆錄轉(zhuǎn)
Real-time RCP
數(shù)據(jù)分析
完成
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